Ayda Modificar el Mod Clash of Kings Con Module System

Hola buenas tarde

Quiero hacer una modificacion del Mod Clash of Kings con el Module System
Realizo todos los pasos que he visto en los diferentes tutoriales.
Pero cuando inicio el build_module en vez de tener los archivos del Clash of Kings tiene los del native,
y encima me sobreescribe todos los archivos en el Clash of Kings con lo consiguiente se queda como el native.

Mi pregunta es , como puedo hacer para evitar que esto suceda, para con el Module System empezar a editar directamente los archivos del Clash of Kings

gracias por las respuestas y perdonar por la forma de expresarme si no la entendeis

es que el module system es con los archivos del native, para crear un mod desde cero, no sirve para modificar un mod ya existente.
La unica forma seria conseguir el module system del clash of king, que me parece no es "open source", o sea, esos archivos MS los tiene solo el creador y no los ha compatido